Aan het einde van mijn tijd bij SACEMA in Zuid-Afrika heb ik bij Roel Bakker van het Erasmus MC afdeling MGZ navraag gedaan of hij nog iemand nodig had voor een baantje en dit was het geval, dus dat ik mooi. Het baantje bestaat er uit dat ik een programma, STDSIM, dat lijkt op degene die ik bij SACEMA aan het ontwikkelen was, maar dan volwassener, moest gaan uitbreiden zodat het makkelijk op verschillende computers tegelijk te draaien viel.
Nog een beetje ingaan op die opdracht: er bestaat een software infrastructuur genaamd BOINC wat een programma op meerdere plekken tegelijk kan draaien, bijvoorbeeld bij mensen thuis, vrijwilligers. Dit moest ik gebruiken voor STDSIM. Andere programma’s die hiervan gebruik maken zijn SETI@home die met de hulp van heel veel computers kijkt of er in de geluiden uit de ruimte signalen van andere buitenaardse wezens zitten. Een ander programma ClimatePrediction.org kijkt met een model naar wat er met het klimaat gaat gebeuren en welke parameters daarvoor belangrijk zijn. Nog een andere maakt combinaties met proteinen om te kijken welke 3D structuur ze zullen hebben. Wat al die programma’s gemeen hebben is dat ze veel kunnen doen doordat er zoveel mensen aan kunnen meerekenen, omdat het voor een enkele computer duizenden jaren zou duren.
Deze opdracht heeft te maken met een organisatie genaamd AFRICA@home. Die willen programma’s die gebruikt worden voor humanitaire zaken in Afrika krachtiger maken door ze BOINC te laten gebruiken. Tot nu toe hebben ze Malariacontrol.net gemaakt, een malariamodel, daar moet STDSIM bijkomen en nog een ander programma, welke nog niet bekend is.
Jij kunt ook eens kijken naar BOINC, het is heel makkelijk te installeren en te gebruiken. Er zijn heel veer verschillende doelen die je daarmee kunt helpen, van wiskundig tot medisch.
Ik heb 5 maanden, 3 dagen per week, om STDSIM helemaal gereed te maken voor BOINC. Nota bene: ik ben in april begonnen.